В 1747 г. церковь сгорела, и сын Л. Ильина поставил новую деревянную Казанскую церковь. Через пятьдесят лет в Хомякове, стараниями и на средства Никиты Артамоновича Тихменова, началось строительство каменного двухпрестольного храма с колокольней. Церковь освятили в 1805 г., устроив в ней, помимо главного престола — в честь Казанской Божией Матери, теплый придел — во имя свт. Николая Чудотворца. 1848 г. рядом с церковью поставили часовню для отпевания усопших. В Хомякове также была школа грамотности. В начале 1930-х гг. храм закрыли.

Последнего настоятеля священника Ивана Садикова расстреляли в ноябре 1937 г., он погребен в общей могиле в Бутове. Здание использовали под различные нужды села, а в 1950-х гг. совсем забросили. В 1990-х годах церковь передали верующим, но из-за отсутствия средств, восстановление шло медленно. В 2001 г. на средства благотворителей храм восстановили полностью. Церкви переданы также земли небольшого лесопарка и два пруда. В храме находятся почитаемые святыни: старинная храмовая Казанская икона Пресвятой Богородицы и современная мироточивая икона прп. Серафима Саровского. Проезд: от Москвы с Ярославского вокзала до ст. Сергиев Посад (71 км) далее автобусом (12 км).