В 1648 г. решили увеличить доход казнь тем, что подняли цену на соль. Вспыхнул бунт, при котором убиты Плещеев, Траханиотов и Чистой - близкие Морозову, - а он выслан из Москвы. По возвращении не занимал никакого официального положения но остался одним из самых близких к царю людей. Один из крупнейших землевладельцев своего времени, он был образцовым хозяином.

Затем сёлами владела его вдова Анна Ильинична, в 1668 г. они перев шли к племяннику, Ивану Глебовичу Морозову, который тоже вскоре умер. Его мать Федосья Прокопьевна, урождённая Соковнина, - знаменитая старообрядческая «боярыня Морозова», последовательница протопопа Аввакума, - погибла в 1675 г. в земляной тюрьме в г. Боровске.

В 1678 г. село было отписано в дворцовое ведомство, здесь жил приказчик, посажены два сада (в верхнем из которых пруд) с вишнями яблонями, смородиной и малиной.

В 1680-х гг. построена каменная церковь Казанской иконы Божией Матери. Она освящена Патриархом Иоакимом в присутствии царевичей Иоанна и Петра. Главной святыней храма была Казанская икона Божией Матери, вклад царицы Натальи Кирилловны, матери Петра

В 1763 г. село пожаловано Фёдору Ивановичу Вадковскому (1712-1783). Он с 1729 г. служил в Семёновском полку, в 1762 г. принимал активное участие в государственном перевороте, приведшем на престол Екатерину II, и «за спасение отечества от угрожавших ему бедствий» ему было пожаловано 800 душ.

С 1765 по 1778 г. Фёдор Иванович командовал лейб-гвардии Семёновским полком. Генерал-аншеф.

В 1779 г. назначен сенатором.

С 1779 по 1790 г. селом владел его сын Илия Фёдорович.

В 1809 г. разобрано окружавшее церковь открытое гульбище.

В 1-й половине XIX в. селом владел князь Сергей Михайлович Голицын (1774-1859)-камергер, почётный и директор Голицынской больницы (1807 г.), член Государственного совета(1837 г.), попечитель Московского учебного округа (1830 г.), кавалер высшего ордена Российской империи-Апостола Андрея Первозванного, ствительный тайный советник (1852 г.), один из самых богатых людей с его времени.

В 1839 г. по проекту архитектора Александра Осиповича Жилярди (1806-1871), двоюродного брата знаменитого Доменико Жилярди, построена трёхъярусная шатровая колокольня - один из ранних примеров псевдорусского стиля в Подмосковье.

Клировая ведомость церкви Казанской иконы Пресвятой Богородицы за 1841 г. сообщает, что в храме было три престола: верхний холодный - Казанской иконы Божией Матери, нижний тёплый - Священномученика Панкратия, в приделе холодный - Святителя Николая Мирликийского.

Причт церковный, положенный по штату, издавна состоял из священника, дьячка и пономаря (в 1722 г. вышел указ «О штате священно- и церковнослужителей при соборах и приходских церквах», по которому количество служащего в храме духовенства должно было соответствовать количеству дворов в приходе: один священник с дьячком и пономарём на 100-150 дворов. Служители, не попавшие в штат, привлекались на государственную службу.

В 1778 г. были приняты новые штаты: один священник на 150 дворов, в 1885 г. один священник и один псаломщик на 700 и менее прихожан). Священно- и церковнослужители получали достаточное жалование от владельца села, князя О.М. Голицына.

В 1840-х гг. настоятелем храма был священник Матфей Алексеевич Орлов (в 1841 г. ему 50 лет).

В 1821 г. по окончании курса в Московской Перервинской Духовной семинарии с аттестатом 2-го разряда он был Рукоположен ко храму с. Котельники. 7 лет состоял в должности депутата (депутаты призывались на заседания в общих судах, в их обязанности входило снятие показаний с духовных лиц, уличённых в уголовных преступлениях, депутаты присутствовали при следствии о лицах Духовного звания, избирались на училищные и общеепархиальные съезды и на заседания земств и городских дум).

В 1833 г. определён благочинным.

В 1841 г. награждён набедренником. В семье о. Матфея и его Жены Надежды Александровны было 6 детей (сын Григорий и 5 дочерей).

В 1890 г. землями в с. Котельники владели вдова штабс-ротмистра София Васильевна Шумова и князь Сергей Михайлович Голицын (1843-1915), почётный опекун, главный директор Голицынской больницы в Москве (с 1873 г.), егермейстер.

В 1925 г. ввиду закрытия Николо-Угрешского монастыря духовные дети больного, парализованного митрополита Макария (Невского) переселили его в нанятый на окраине с. Котельники дом, в котором устроили домовую церковь. При владыке были келейник игумен Аркадий и Ольга Серафимовна Дефендова i(монахиня Серафима). Владыка по болезни принуждён был лежать в постели и мог передвигаться только в инвалидном кресле. В 1925 г. с Алтая при ехала игумения Людмила с 11-ю монахинями из закрытого Чемальского монастыря, основанного в 1911 г. владыкой. Митрополит Макарий жил в большой, недостаточно отапливаемой комнате, заболел воспалением легких и в этом доме скончался 1 марта 1926 г., похоронен в ограде церкви с. Котельники.

Игумения Людмила с сестрами ещё полгода пребывала в доме, сестры стегали одеяла для крестьян и тем зарабатывали себе пропитание, но вскоре налоги стали непосильными, и по общему согласию все разошлись по сёлам. В покинутом доме осталась одна Ольга Серафимовна.

Хозяйка перестала топить в её комнате. Власти были недовольны паломничеством верующих на могилу владыки.

Вскоре дом, в котором скончался митрополит Макарий, сгорел. Ольге Серафимовне власти предложили уехать

В 1936 г. в Казанский храм с. Котельники назначен служить протоиерей Вячеслав Занков, будущий священномученик. Вячеслав Сергеевич родился в 1892 г. в г. Сычёвке Смоленской губернии, в дворянской семье.

Его отец служил инспектором народных училищ Москвы и губернии.

В 1914 г. Вячеслав Сергеевич поступил в Московский университет, который окончил в 1918 г. и стал учителем школы № 11 Рогожско-Симоновского района Москвы.

В 1920 и 1921 гг. работал в отделе народного образования того же района, а в 1921-1923 гг. был сотрудником отдела высших учебных заведений Народного комиссариата просвещения. В это время он уже был священником - рукоположен в 1920 г. ко храму Святой Троицы, что в Зубове в Москве, в котором прослужил до 1932 г., когда был переведён в храм Святителя Николая в Хамовниках. Возведён в сан протоиерея.

В 1934 г. награждён крестом с украшениями. В том же году переведён в Покровскую церковь в селе Черкизово, а в 1936 г. назначен служить в Казанский храм с. Котельники. На новом месте он организовал ремонт храма, продолжал неустанно проповедовать слово Божие, призывал прихожан к усердной молитве. Позднее председатель сельсовета обвинил его в том, что он «ведёт агитацию… среди подростков и детей. Заставляет их молиться». А свидетельница по делу показывала: «Во время похорон моего ребенка в церкви были дети», и священник Занков сказал им: «Вы, девочки, молитесь и пойте за мной». Одну из этих девочек вызвали на допрос в НКВД, и она подтвердила что «многие школьники ходят в церковь к Занкову».

Протоиерея Вячеслава арестовали в ночь с 16 на 17 сентября 1937 г. 13 октября того же года он был расстрелян на полигоне Бутово под Москвой.

Осенью 1937 г. церковь закрыта, настоятеля о. Иоанна Нерадовского выслали в лагеря, шесть монахов Николо-Угрешского монастыря, поселившихся после его закрытия в церковной сторожке и служивших в Котельническом храме, также высланы. Здание передано военным и окружено колючей проволокой. Вскоре дом, в котором скончался митрополит Макарий, сгорел. 16 апреля 1957 г., после освидетельствования комиссией Московской патриархии, возглавляемой Святейшим Патриархом Алексием I, честные нетленные останки святителя Макария Перенесены в Троице-Сергиеву лавру, в храм Русских Святых в подклете Успенского собора.

14 апреля 1937 г. в Котельниках был арестован епископ Арсений (Жадановский). До 1923 г. он был епископом Серпуховским, в тот год неоднократно арестовывался, в 1926 г. выслан в Нижегородскую губернию, арестовывался также в 1931, 1932, 1933 гг., между арестами жил у своих духовных чад.

Арест в Котельниках стал последним: 27 сентября 1937 г. владыка Арсений с четырьмя священниками и тремя монахинями, проходившими по его делу, был расстрелян. Храм с. Котельники был закрыт, лишился пятиглавия и верхних ярусов колокольни, на нижнем ярусе построена водонапорная башня.

В 1990 г. возвращён верующим и восстанавливается.

В границы пос. Котельники вошла усадьба Покровское (Белая дача). Дом и флигели построены в конце XVIII в. при владельце усадьбы, тайном советнике Николае Яковлевиче Аршеневском (ум. 1802). При императоре Павле I он был астраханским губернатором.