В настоящее время это самый высокий деревянный храм. Архитектура церкви святителя Николая очень сложная и чрезвычайно оригинальная по своему общему композиционному строю. Прямоугольный четырехстенный сруб, стоящий на подклети, несет другой, восьмиугольный объем, покрытый очень высоким, стройным шатром с небольшой главкой. В верхнем ярусе шатра располагается колокольня. Храм опоясан крытой галереей с широким крыльцом. С четырех сторон в храм врезаются бочки, которые не только расширили сооружение, но и предали ему большую живописность. Иконостас храма выполнен мастерами поселка Мстера (Владимирской области), имеет три яруса, украшен резьбой: зеленые переплетенные ветви на красном фоне. При храме действуют Школа флористики и Воскресная школа. Занятия для детей проходят в помещениях Измайловского кремля, а также в самом храме каждое воскресенье после Божественной Литургии.