А уже 1571 году село Карачарово было во владении Спасо-Андроникова монастыря. События Смутного времени начала XVII века привели к тому, что село было разорено, запустело и по описанию 1624 года значится пустошью. У обители не было средств восстановить свое подмосковное владение, и оно было отдано «на строение Василию Стрешневу», который нуждался в близкой подмосковной земле и после своей смерти обязывался возвратить имение монастырю со всей построенной им недвижимостью.

Вскоре Стрешнев поставил на пустоши Карачаровой для себя двор, рядом поселил крестьян и возвел две церкви – церковь Трех святителей вселенских и церковь Знамения Пресвятыя Богородицы. В 1661 году Карачарово было возвращено Спасо-Андроникову монастырю. И с этого времени на протяжении почти столетия Карачарово находилось в монастырском владении. По описанию 1678 года здесь значилось 22 крестьянских двора, в которых проживало 64 человека и 3 человека на монастырском дворе.

В 1764 году все монастырские владения были секуляризованы и перешли в собственность Коллегии экономии . На рубеже 1770-1780-х в селе возводится сохранившаяся и поныне Троицкая церковь с колокольней. Во второй половине XIX века Карачарово стало превращаться в дачную местность. Этот процесс ускорился после прокладки путей Рязанской и Нижегородской железных дорог. В 1884 году село располагало земским училищем, тремя овощными лавками, трактиром, ста дворами с населением 260 человек. С конца 1930-х годов вошло в состав города Перово. С включением этих мест в черту Москвы здесь с середины 1960-х годов разворачивается массовое строительство. Район: Юго-Восточный, Нижегородский. Близлежащие метро: Волгоградский проспект, Пролетарская.