Высокие стены и глубокий овраг делали южную сторону крепости практически неприступной. С северо-восточной стороны был вырыт ров и построено больше башен, так как этот участок считался более опасным.

После постройки крепости Ям передовая роль перешла к ней. В начале XVI века, после вхождения Новгорода в состав Московского государства, крепость была усовершенствована - усилены башни и стены для защиты от пушек.

В XVI-XVII веках крепость неоднократно переходила от русских к шведам и обратно. В 1703 году войска Петра I окончательно отвоевали её у шведов. В 1763 году Копорье было исключено из состава крепостей.

В восточной части находятся Северная и Южная башни с воротами между ними. Изначально к воротам вел подъемный мост. Внутристенные и внутрибашенные ходы сохранились лучше, чем внешние стены.

Сейчас крепость находится в запустении, реставрация не ведется. Но величественные башни по-прежнему смотрят в ту сторону, откуда когда-то приходили враги.