Музей расположен в старинной московской местности Крутицы (в прошлом деревня, позднее влившаяся в состав города) на территории памятника промышленной архитектуры конца XIX - начала XX в, здания, в котором с 1898 года находилась главная канализационная насосная станция столицы. Эта станция строилась по проекту русского архитектора М. К. Геппенера.