В 1929-1937 гг. в Троицком соборе служил сщмч. отец Петр (Ворона), который был расстрелян в 1937 г., ныне причислен к лику святых. С 1990 г. при настоятеле протоиерее Александре Ганаба многие священнослужители прошли здесь подготовку и получили основы знаний для пастырского служения, а по рукоположении проходили тут богослужебную практику. В это же время при соборе была открыта самая большая воскресная школа Московской епархии. 9 сентября 2001 г. Троицкий собор посетил Патриарх Московский и всея Руси Алексий II. В 2002 г. создана Православная молодежная организация «Протос», призванная объединить подростков в труде, занятиях, отдыхе и паломничестве.Рядом с собором устроен крестильный храм для крещения взрослых с полным погружением, освященный в честь сщмч. Владимира, митрополита Киевского и Галицкого. В храме находятся особо чтимые святыни: Иерусалимская икона Божией Матери, почитаемая подольчанами за избавление в 1866 г. города от холеры; два мощевика с частицами мощей 140 святых, икона новомучеников Подольских и вновь написанные — икона Божией Матери «Неупиваемая чаша» со всеми святыми и икона Собора новомучеников и исповедников Российских. Проезд: от Москвы с Курского вокзала до ст. Подольск (43 км).