Фактически проект предполагал строительство нового города и его одновременную интеграцию с Зеленоградом. Предполагалось, что в отличие от ранее созданного (в 1962 году) НПО «Научный центр», который подчинялся Министерству электронной промышленности, новый центр должен был стать межведомственным с последующим выходом на международный уровень в рамках СЭВ. В 1987 году для целей строительства производственных площадей и жилья для работников центра в территорию города Зеленограда был включён посёлок Крюково вместе с прилегающими территориями. В связи с распадом СССР строительство производственных площадей было брошено на нулевом цикле, при том, что строительство жилого фонда было продолжено.

Возникший дисбаланс в отношении количества жителей и рабочих мест, усугублённый кризисом российской экономики после распада СССР, привёл к большой транспортной проблеме в городе, как внутренней, так и внешней. В настоящее время о Центре напоминают только Институт проблем проектирования в микроэлектронике РАН (единственный исследовательский институт, который успели создать до закрытия проекта) и Развалины ЦИЭ, где теперь располагаются зеленоградская таможня и складские помещения, которые по плану будут снесены к 2020 году для строительства на них месте 21 и 22 микрорайонов — последних микрорайонов города. Сходство с коллайдером ему придает кольцевая форма намеченного строительства и наличие спаренных тоннелей 3х3 метра - остатки недостроенного кольцевого тепло-кабельного коллектора.